Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms