Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms