Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSP90AB1P08238 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms