Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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VEGFDO43915 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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VEGFDO43915 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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VEGFDO43915 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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VEGFDO43915 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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VEGFDO43915 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
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VEGFDO43915 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
VEGFDO43915 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VEGFDO43915 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VEGFDO43915 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VEGFDO43915 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VEGFDO43915 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VEGFDO43915 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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