Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSH5O43196 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSH5O43196 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSH5O43196 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MSH5O43196 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSH5O43196 AP001020.1-201ENST00000579595 464 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSH5O43196 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSH5O43196 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MSH5O43196 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSH5O43196 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSH5O43196 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSH5O43196 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSH5O43196 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSH5O43196 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSH5O43196 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSH5O43196 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSH5O43196 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSH5O43196 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSH5O43196 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSH5O43196 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSH5O43196 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSH5O43196 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSH5O43196 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSH5O43196 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSH5O43196 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSH5O43196 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSH5O43196 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSH5O43196 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSH5O43196 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSH5O43196 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSH5O43196 DEFT1P-201ENST00000453425 496 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MSH5O43196 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSH5O43196 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSH5O43196 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSH5O43196 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSH5O43196 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSH5O43196 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSH5O43196 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSH5O43196 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MSH5O43196 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSH5O43196 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSH5O43196 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSH5O43196 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSH5O43196 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSH5O43196 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSH5O43196 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSH5O43196 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSH5O43196 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSH5O43196 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSH5O43196 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSH5O43196 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MSH5O43196 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MSH5O43196 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MSH5O43196 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MSH5O43196 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MSH5O43196 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MSH5O43196 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MSH5O43196 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MSH5O43196 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MSH5O43196 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MSH5O43196 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MSH5O43196 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MSH5O43196 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MSH5O43196 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MSH5O43196 AC018362.1-201ENST00000564805 846 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MSH5O43196 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MSH5O43196 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MSH5O43196 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MSH5O43196 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MSH5O43196 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MSH5O43196 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MSH5O43196 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MSH5O43196 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MSH5O43196 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MSH5O43196 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MSH5O43196 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MSH5O43196 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MSH5O43196 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MSH5O43196 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MSH5O43196 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MSH5O43196 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MSH5O43196 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MSH5O43196 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MSH5O43196 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MSH5O43196 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MSH5O43196 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MSH5O43196 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MSH5O43196 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MSH5O43196 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MSH5O43196 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MSH5O43196 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MSH5O43196 FP565260.4-201ENST00000624081 513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MSH5O43196 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MSH5O43196 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MSH5O43196 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MSH5O43196 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MSH5O43196 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
MSH5O43196 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MSH5O43196 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MSH5O43196 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms