Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLRMTO00411 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms