Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms