Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
E9PCH4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
E9PCH4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
E9PCH4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
E9PCH4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
E9PCH4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
E9PCH4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
E9PCH4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
E9PCH4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
E9PCH4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
E9PCH4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
E9PCH4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
E9PCH4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
E9PCH4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
E9PCH4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
E9PCH4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
E9PCH4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
E9PCH4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
E9PCH4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
E9PCH4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
E9PCH4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
E9PCH4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
E9PCH4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
E9PCH4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
E9PCH4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
E9PCH4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
E9PCH4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
E9PCH4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
E9PCH4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
E9PCH4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
E9PCH4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
E9PCH4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
E9PCH4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
E9PCH4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
E9PCH4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
E9PCH4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
E9PCH4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
E9PCH4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
E9PCH4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
E9PCH4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
E9PCH4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
E9PCH4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
E9PCH4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
E9PCH4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
E9PCH4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
E9PCH4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
E9PCH4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
E9PCH4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
E9PCH4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
E9PCH4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
E9PCH4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
E9PCH4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
E9PCH4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
E9PCH4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
E9PCH4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
E9PCH4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
E9PCH4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
E9PCH4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
E9PCH4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
E9PCH4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
E9PCH4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
E9PCH4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
E9PCH4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
E9PCH4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
E9PCH4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
E9PCH4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
E9PCH4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
E9PCH4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
E9PCH4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
E9PCH4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
E9PCH4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
E9PCH4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
E9PCH4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
E9PCH4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
E9PCH4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
E9PCH4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
E9PCH4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
E9PCH4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
E9PCH4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
E9PCH4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
E9PCH4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
E9PCH4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
E9PCH4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
E9PCH4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
E9PCH4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
E9PCH4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
E9PCH4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
E9PCH4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
E9PCH4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
E9PCH4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
E9PCH4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
E9PCH4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
E9PCH4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
E9PCH4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
E9PCH4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
E9PCH4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
E9PCH4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
E9PCH4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
E9PCH4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
E9PCH4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms