Protein–RNA interactions for Protein: B4DSR2

cDNA FLJ52234, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DSR2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DSR2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DSR2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DSR2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DSR2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DSR2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DSR2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DSR2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DSR2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DSR2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DSR2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DSR2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DSR2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DSR2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DSR2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DSR2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DSR2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DSR2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DSR2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DSR2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DSR2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DSR2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DSR2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
B4DSR2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
B4DSR2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
B4DSR2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
B4DSR2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
B4DSR2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
B4DSR2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
B4DSR2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
B4DSR2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DSR2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DSR2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DSR2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DSR2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DSR2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DSR2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DSR2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DSR2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DSR2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DSR2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DSR2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DSR2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DSR2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DSR2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DSR2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DSR2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DSR2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DSR2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DSR2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DSR2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DSR2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DSR2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DSR2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DSR2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DSR2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DSR2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DSR2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DSR2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DSR2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DSR2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DSR2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DSR2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DSR2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DSR2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DSR2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DSR2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DSR2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DSR2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DSR2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DSR2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DSR2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DSR2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DSR2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DSR2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DSR2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DSR2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DSR2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DSR2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DSR2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DSR2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DSR2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DSR2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DSR2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DSR2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DSR2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DSR2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DSR2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DSR2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DSR2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DSR2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DSR2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DSR2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DSR2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DSR2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DSR2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DSR2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DSR2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DSR2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DSR2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms