Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms