Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms