Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SERINC4A6NH21 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms