Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSDA5PKW4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms