Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM89A2RUT3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms