Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms