Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 CNGB1-204ENST00000564448 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 BTBD3-203ENST00000399006 4826 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TRUB2-201ENST00000372890 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF23-201ENST00000260363 3713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TBX19-201ENST00000367821 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ACTN4P1-201ENST00000514175 1451 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 UHRF1-205ENST00000620565 3965 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 DIS3L2-202ENST00000325385 3501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 GRAMD1B-206ENST00000529432 6266 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SKP2-202ENST00000274255 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AFF4-203ENST00000378595 3348 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PCSK7-215ENST00000540028 3332 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MAN2C1-224ENST00000565683 3300 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ALDH3A2-202ENST00000339618 3828 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 KRTAP12-3-201ENST00000397907 410 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01518-201ENST00000411439 519 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AL450322.1-201ENST00000415358 313 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MED15P4-201ENST00000417579 393 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PTMAP4-201ENST00000426188 346 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC073188.1-201ENST00000442493 361 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC006455.3-201ENST00000454641 333 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC069454.1-201ENST00000465845 468 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC018638.2-201ENST00000471258 403 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC136632.1-201ENST00000477964 591 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL209P-201ENST00000488309 276 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CUTA-213ENST00000494751 731 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC083841.3-202ENST00000519411 349 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CALCP-201ENST00000522108 212 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AP003550.1-201ENST00000522416 414 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC138331.1-201ENST00000549993 376 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC091544.3-202ENST00000554246 373 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL663P-201ENST00000578592 299 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC032019.1-201ENST00000579100 173 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC097641.2-201ENST00000581517 325 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4647-201ENST00000583964 80 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC103809.1-201ENST00000585167 651 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007450.3-201ENST00000620115 247 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6742-201ENST00000622338 62 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AL021920.3-201ENST00000633433 819 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SEMA4G-205ENST00000517724 2675 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RIPOR1-201ENST00000042381 4051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF587-201ENST00000339656 6882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PCSK9-201ENST00000302118 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 METAP2-202ENST00000323666 3601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SRSF10-203ENST00000343255 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC16A1-AS1-204ENST00000428411 8757 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO18B-205ENST00000536101 8051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CICP5-201ENST00000424045 2215 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MYH13-201ENST00000252172 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CFAP65-202ENST00000341552 5953 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PNPLA7-201ENST00000277531 4581 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 DDR1-239ENST00000452441 3857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PTOV1-AS1-202ENST00000600742 3181 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRP1-202ENST00000269280 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PTGIS-201ENST00000244043 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RUNX1T1-250ENST00000614812 7483 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ACTN2-201ENST00000366578 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF207-201ENST00000377939 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NUTM1-202ENST00000438749 3922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF15-201ENST00000361926 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CFAP43-202ENST00000357060 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM13B-202ENST00000420893 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNAB1-215ENST00000618897 4437 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NEPRO-202ENST00000383675 4672 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.4 ms