Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms