Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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COL24A1Q17RW2 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
COL24A1Q17RW2 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
COL24A1Q17RW2 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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COL24A1Q17RW2 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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COL24A1Q17RW2 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
COL24A1Q17RW2 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
COL24A1Q17RW2 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
COL24A1Q17RW2 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
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COL24A1Q17RW2 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
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COL24A1Q17RW2 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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COL24A1Q17RW2 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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COL24A1Q17RW2 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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COL24A1Q17RW2 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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