Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms