Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CSHL1Q14406 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms