Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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CNGB1Q14028 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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CNGB1Q14028 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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CNGB1Q14028 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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CNGB1Q14028 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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