Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.3 ms