Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EPHB4P54760 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
EPHB4P54760 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms