Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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CENPFP49454 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CENPFP49454 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CENPFP49454 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CENPFP49454 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CENPFP49454 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CENPFP49454 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CENPFP49454 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CENPFP49454 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CENPFP49454 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CENPFP49454 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CENPFP49454 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CENPFP49454 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CENPFP49454 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CENPFP49454 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CENPFP49454 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CENPFP49454 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CENPFP49454 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CENPFP49454 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CENPFP49454 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CENPFP49454 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CENPFP49454 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CENPFP49454 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CENPFP49454 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CENPFP49454 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CENPFP49454 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CENPFP49454 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CENPFP49454 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CENPFP49454 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CENPFP49454 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CENPFP49454 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CENPFP49454 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CENPFP49454 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CENPFP49454 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CENPFP49454 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CENPFP49454 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CENPFP49454 AC063923.1-201ENST00000478982 1619 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CENPFP49454 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
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CENPFP49454 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
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CENPFP49454 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CENPFP49454 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CENPFP49454 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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CENPFP49454 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CENPFP49454 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CENPFP49454 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CENPFP49454 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CENPFP49454 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CENPFP49454 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CENPFP49454 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CENPFP49454 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CENPFP49454 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CENPFP49454 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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