Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
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