Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 UIMC1-207ENST00000506128 1945 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
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