Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms