Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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