Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC4.03□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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CUL3Q13618 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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CUL3Q13618 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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CUL3Q13618 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
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CUL3Q13618 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
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CUL3Q13618 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL3Q13618 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
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