Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms