Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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