Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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