Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms