Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
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PTPRBP23467 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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PTPRBP23467 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
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PTPRBP23467 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
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PTPRBP23467 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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