Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
DMDP11532 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DMDP11532 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DMDP11532 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DMDP11532 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
DMDP11532 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
DMDP11532 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DMDP11532 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
DMDP11532 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
DMDP11532 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DMDP11532 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DMDP11532 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DMDP11532 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DMDP11532 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
DMDP11532 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
DMDP11532 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
DMDP11532 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DMDP11532 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DMDP11532 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DMDP11532 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DMDP11532 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
DMDP11532 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DMDP11532 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
DMDP11532 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
DMDP11532 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
DMDP11532 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
DMDP11532 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DMDP11532 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DMDP11532 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
DMDP11532 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
DMDP11532 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DMDP11532 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DMDP11532 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DMDP11532 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
DMDP11532 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
DMDP11532 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
DMDP11532 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
DMDP11532 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DMDP11532 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DMDP11532 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DMDP11532 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DMDP11532 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DMDP11532 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
DMDP11532 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
DMDP11532 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
DMDP11532 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DMDP11532 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DMDP11532 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DMDP11532 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
DMDP11532 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DMDP11532 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
DMDP11532 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DMDP11532 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DMDP11532 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
DMDP11532 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DMDP11532 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
DMDP11532 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
DMDP11532 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DMDP11532 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
DMDP11532 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DMDP11532 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DMDP11532 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
DMDP11532 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DMDP11532 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DMDP11532 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
DMDP11532 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DMDP11532 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
DMDP11532 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
DMDP11532 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
DMDP11532 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DMDP11532 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DMDP11532 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
DMDP11532 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
DMDP11532 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
DMDP11532 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
DMDP11532 MDM4-214ENST00000612738 9407 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
DMDP11532 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DMDP11532 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
DMDP11532 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DMDP11532 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
DMDP11532 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
DMDP11532 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
DMDP11532 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DMDP11532 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DMDP11532 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
DMDP11532 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DMDP11532 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
DMDP11532 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
DMDP11532 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
DMDP11532 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
DMDP11532 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
DMDP11532 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
DMDP11532 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
DMDP11532 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
DMDP11532 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
DMDP11532 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
DMDP11532 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
DMDP11532 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
DMDP11532 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DMDP11532 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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