Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CSPP1Q1MSJ5 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms