Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FXNQ16595 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FXNQ16595 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FXNQ16595 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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FXNQ16595 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FXNQ16595 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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