Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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