Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CUL4AQ13619 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
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