Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
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