Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 AC079600.3-201ENST00000547898 447 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 AC011595.1-201ENST00000548901 753 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 AC138811.1-201ENST00000569096 361 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.27-201ENST00000617573 258 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 TMCC1-203ENST00000432054 5631 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 SLC30A8-205ENST00000519688 5242 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 TBX5-202ENST00000349716 3585 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 PLEKHA5-201ENST00000299275 4238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 NBPF14-201ENST00000581201 2931 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 NBPF26-206ENST00000617913 2931 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 CACNA1D-201ENST00000288139 9341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 ZNF585B-204ENST00000531805 2971 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 HUS1-201ENST00000258774 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 FSTL5-203ENST00000427802 2920 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 SNORA73B-201ENST00000363217 204 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
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MKRN4PQ13434 AC005517.1-201ENST00000452091 489 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
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MKRN4PQ13434 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
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MKRN4PQ13434 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 NXT2-203ENST00000372106 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 SPATS2-222ENST00000552918 2993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 DAZ1-203ENST00000426000 1846 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 AC242022.1-201ENST00000638002 1565 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 ADA2-202ENST00000330232 3195 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
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MKRN4PQ13434 NFIB-205ENST00000380959 8198 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
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MKRN4PQ13434 ZSCAN12-201ENST00000361028 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 ODF2L-203ENST00000359242 7560 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
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MKRN4PQ13434 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
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MKRN4PQ13434 KCNK2-203ENST00000444842 3379 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
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MKRN4PQ13434 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 FTOP1-201ENST00000419363 861 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 DBIL5P2-201ENST00000443827 253 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
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MKRN4PQ13434 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 RN7SL332P-201ENST00000482163 254 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 ZNF525-204ENST00000491101 569 ntTSL 4 BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 AC023827.2-201ENST00000566880 1061 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 AC091544.5-201ENST00000620192 3815 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
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