Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NME3Q13232 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
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