Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms