Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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CNTN1Q12860 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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CNTN1Q12860 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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CNTN1Q12860 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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CNTN1Q12860 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CNTN1Q12860 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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