Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms