Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms