Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 DCX-205ENST00000488120 2476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 AC004672.1-201ENST00000513082 2088 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 Z97832.2-201ENST00000605896 4261 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 MIR17HG-202ENST00000581816 2032 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 AL121916.1-201ENST00000429405 308 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 AC114755.4-201ENST00000439114 443 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 AC006487.2-201ENST00000503624 577 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 SCRN3-201ENST00000272732 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 PTK2-240ENST00000522684 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 TCL6-201ENST00000352367 3398 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 VCAM1-204ENST00000370119 2483 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 MID1-201ENST00000317552 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 CYP4F30P-203ENST00000438109 2250 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 OR4F17-203ENST00000618231 2586 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 PLAGL1-205ENST00000392307 6296 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 ACKR2-202ENST00000442925 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 LINC01568-201ENST00000554640 2544 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 FBXL4-202ENST00000369244 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 SRGAP2-203ENST00000573034 6301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 ZNF107-204ENST00000423627 5773 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 OR7E25P-202ENST00000641088 5937 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 BRINP3-201ENST00000367462 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 AL355488.1-201ENST00000449169 2611 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 MMP25-AS1-206ENST00000573130 4434 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 JAKMIP2-201ENST00000265272 6001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 COA1-203ENST00000395879 2448 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 ELP4-229ENST00000640961 8164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 RN7SKP232-201ENST00000410170 290 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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LHX8Q68G74 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 MIR3135A-201ENST00000578460 77 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 C1orf21-201ENST00000235307 10265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 RORB-202ENST00000396204 2996 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 ZNF844-202ENST00000441304 2036 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 RXFP1-207ENST00000470033 2175 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 RUNDC3A-AS1-202ENST00000588097 5203 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 ARHGAP32-202ENST00000392657 6556 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 SCAPER-202ENST00000324767 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 MDM2-202ENST00000258149 12633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 SLA-201ENST00000338087 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 AC090983.1-201ENST00000623426 3897 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 PKD1L1-201ENST00000289672 9092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 NCKAP1L-201ENST00000293373 9016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 ATP1A4-201ENST00000368081 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 ERG-205ENST00000398910 4954 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 HTR2C-202ENST00000371950 4652 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 PIGN-238ENST00000639758 4239 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 DPY19L3-205ENST00000586987 5925 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 ABCA1-202ENST00000374736 10494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 ZNF845-202ENST00000595091 4413 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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