Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC4.53□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
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FOXE3Q13461 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
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FOXE3Q13461 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
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FOXE3Q13461 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
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FOXE3Q13461 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
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FOXE3Q13461 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
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