Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SRSF5Q13243 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SRSF5Q13243 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SRSF5Q13243 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SRSF5Q13243 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SRSF5Q13243 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SRSF5Q13243 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SRSF5Q13243 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SRSF5Q13243 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SRSF5Q13243 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SRSF5Q13243 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SRSF5Q13243 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SRSF5Q13243 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SRSF5Q13243 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SRSF5Q13243 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SRSF5Q13243 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SRSF5Q13243 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SRSF5Q13243 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SRSF5Q13243 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SRSF5Q13243 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SRSF5Q13243 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SRSF5Q13243 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SRSF5Q13243 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SRSF5Q13243 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SRSF5Q13243 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SRSF5Q13243 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SRSF5Q13243 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SRSF5Q13243 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
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