Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KCNH2Q12809 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.8 ms